Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf123Q5XPI3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms