Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Trim38Q5SZ99 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Trim38Q5SZ99 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Trim38Q5SZ99 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Trim38Q5SZ99 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Trim38Q5SZ99 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim38Q5SZ99 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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