Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psme4Q5SSW2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms