Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Utp18Q5SSI6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Utp18Q5SSI6 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms