Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Rtl5Q5DTT4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Rtl5Q5DTT4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Rtl5Q5DTT4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Rtl5Q5DTT4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Rtl5Q5DTT4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Rtl5Q5DTT4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Rtl5Q5DTT4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Rtl5Q5DTT4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Rtl5Q5DTT4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Rtl5Q5DTT4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl5Q5DTT4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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