Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Fam220aQ3ZN08 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Fam220aQ3ZN08 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
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