Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pacs2Q3V3Q7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms