Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm28047Q3US59 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm28047Q3US59 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms