Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Znf48Q3US17 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Znf48Q3US17 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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