Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
E130208F15RikQ3UPV3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms