Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem253Q3UNB8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms