Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ankrd27Q3UMR0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ankrd27Q3UMR0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ankrd27Q3UMR0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ankrd27Q3UMR0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ankrd27Q3UMR0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ankrd27Q3UMR0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Ankrd27Q3UMR0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ankrd27Q3UMR0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ankrd27Q3UMR0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ankrd27Q3UMR0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ankrd27Q3UMR0 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Ankrd27Q3UMR0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ankrd27Q3UMR0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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