Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ceacam12Q3UKP4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms