Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3b2Q3UJB0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms