Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Zyg11bQ3UFS0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zyg11bQ3UFS0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zyg11bQ3UFS0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zyg11bQ3UFS0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zyg11bQ3UFS0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zyg11bQ3UFS0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zyg11bQ3UFS0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zyg11bQ3UFS0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zyg11bQ3UFS0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zyg11bQ3UFS0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zyg11bQ3UFS0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zyg11bQ3UFS0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zyg11bQ3UFS0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zyg11bQ3UFS0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zyg11bQ3UFS0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Zyg11bQ3UFS0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Zyg11bQ3UFS0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms