Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trafd1Q3UDK1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms