Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Kdm4dQ3U2K5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms