Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rnf149Q3U2C5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rnf149Q3U2C5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rnf149Q3U2C5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rnf149Q3U2C5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rnf149Q3U2C5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rnf149Q3U2C5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rnf149Q3U2C5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rnf149Q3U2C5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rnf149Q3U2C5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Rnf149Q3U2C5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rnf149Q3U2C5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Rnf149Q3U2C5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rnf149Q3U2C5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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