Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnnm2Q3TWN3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnnm2Q3TWN3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms