Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccndbp1Q3TVC7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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