Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ctdnep1Q3TP92 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ctdnep1Q3TP92 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ctdnep1Q3TP92 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ctdnep1Q3TP92 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ctdnep1Q3TP92 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ctdnep1Q3TP92 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Ctdnep1Q3TP92 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Ctdnep1Q3TP92 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ctdnep1Q3TP92 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ctdnep1Q3TP92 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
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