Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf3c3Q3TMP1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gtf3c3Q3TMP1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms