Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl9Q32KG4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl9Q32KG4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl9Q32KG4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl9Q32KG4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl9Q32KG4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl9Q32KG4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rtl9Q32KG4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms