Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm1123Q1RME4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm1123Q1RME4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms