Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cpne9Q1RLL3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cpne9Q1RLL3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cpne9Q1RLL3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cpne9Q1RLL3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Cpne9Q1RLL3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cpne9Q1RLL3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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