Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpusd2Q149F1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms