Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf3ip1Q149C2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Traf3ip1Q149C2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms