Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Ttc39dQ0VF76 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ttc39dQ0VF76 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ttc39dQ0VF76 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ttc39dQ0VF76 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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