Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ttc21bQ0HA38 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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