Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnnm1Q0GA42 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnnm1Q0GA42 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms