Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tgm3Q08189 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms