Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdx4Q07424 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms