Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Nf1Q04690 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms