Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Htr1fQ02284 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Htr1fQ02284 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms