Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
EgfrQ01279 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EgfrQ01279 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms