Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
PrcdQ00LT2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms