Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Atp9bP98195 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Atp9bP98195 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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