Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Tp53bp1P70399 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Tp53bp1P70399 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tp53bp1P70399 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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