Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NfixP70257 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NfixP70257 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms