Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Traf5P70191 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Traf5P70191 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms