Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rps11P62281 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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