Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Lmo4P61969 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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