Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl27P61358 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl27P61358 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl27P61358 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl27P61358 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl27P61358 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl27P61358 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl27P61358 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rpl27P61358 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rpl27P61358 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms