Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ppfia3P60469 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms