Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Pcmtd1P59913 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcmtd1P59913 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcmtd1P59913 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcmtd1P59913 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcmtd1P59913 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcmtd1P59913 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcmtd1P59913 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcmtd1P59913 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcmtd1P59913 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcmtd1P59913 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcmtd1P59913 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcmtd1P59913 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcmtd1P59913 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pcmtd1P59913 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms