Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csrnp1P59054 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms