Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P58686 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
P58686 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P58686 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P58686 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P58686 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P58686 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P58686 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P58686 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P58686 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
P58686 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P58686 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P58686 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P58686 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P58686 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P58686 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P58686 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms