Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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NcstnP57716 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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NcstnP57716 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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NcstnP57716 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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NcstnP57716 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
NcstnP57716 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
NcstnP57716 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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