Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf5P56477 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf5P56477 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Irf5P56477 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf5P56477 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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