Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sh3bp1P55194 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1P55194 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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